Glavni alergeni u jesen su polen, grinje za prašinu, kalup itd.
U mnogim regijama, vrste i količine alergenskih polena postepeno se povećavaju nakon početka jeseni, ulazeći u vrh alergije polen. Pored toga, alergeni polena u jesen uglavnom su korova polen, što ima jaču alergenost.
Glavni izvori jesenjeg polena uključuju artemisijske biljke (poput Artemisia Annua), biljaka Chenopodiaceae (poput sivog povrća) i biljke ragweed. Među njima je polen artemisijskih biljaka posebno aktivna u jesen, a neki ljudi mogu osjetiti ozbiljne alergijske reakcije sa samo malom količinom Artemisia Pollena.
Pored toga, vlaga i temperatura u kasnom ljetu i ranu jesenju stvaraju povoljne uvjete za grinje za prašinu i također su vrlo pogodni za rast kalupa. Jesensko jutarnje rose ili preostale kiše, pali lišće i raspadanje vegetacije mogu promovirati rast kalupa. Kada ljudi dođu u kontakt sa ili udišu spore plijesni, oni su takođe skloni alergijama.
Istovremeno, nakon pada temperature u jesen, vrijeme postaje suho i količina malih čestica poput prašine u zraku povećava se, postajući važni alergeni. Velika temperaturna razlika između dana i noći u jesen i stimulacija hladnog zraka na nazalnoj sluznici može dovesti do vazokonstrikcije i smanjene funkcije barijere, inducira osjetljivost.
